Efter C12 kom Pagani med C12-S der I bund og grund bare fik en motor opgradering, med en AMG V12 i stedet for standard Mercedes V12. Pagani ville gerne gøre C12 til en rigtig superbil, så han bad AMG om at levere flere M120 V12 7,0 motorer. Det gjorde helt klart en forskel i bilens ydelse, Zonda C12-S accelererede til 100 km/t på kun 3,7 sek.

MotorCenter monteret M 120 E 72 AMG 60° V12, DOHC med 3 ventiler pr. cyl. indsprøjtning
Volumen7010 ccm
Effekt410,1 kw / 550 hk ved 5500 o/min
Moment750 nm ved 4100 o/min
Karosseri / ChassisKulfiber og stål
Fordæk255/40 ZR-18
Bagdæk345/35 ZR-18
BremserVentilerede skiver
StyringTandstang
AffjedringDobbelte wishbones med spiralfjedre, støddæmpere, anti-roll stang
Vægt1350 kg
Akselafstand2730 mm
Sporvidde for1675 mm
Sporvidde bag1660 mm
Længde4345 mm
Bredde1933 mm
Højde1151 mm
Gearkasse6-trins
Top hastighed~340 km/t
0 – 100 km/t~3,7 sek